107La plate-forme Cytocell, située au sein du pôle santé de l'université de Nantes, propose un ensemble de prestations axées autour de la cytométrie en flux multi-paramétrique, du tri cellulaire et de l'imagerie en cytométrie.
La plate-forme possède les compétences scientifiques et techniques pour tous vos projets scientifiques en sciences du vivant.
Le personnel de la plate-forme Cytocell s'investit fortement dans la formation à la cytométrie en flux au niveau régional comme au niveau national.
La plate-forme est une structure ouverte à tous les personnels appartenant aux unités constituantes de la SFR Santé François Bonamy mais également aux unités de recherche extérieures à la structure fédérative de recherche et aux entreprises privées.

Savoir-faire


La cytométrie en flux est une technique rapide et précise de caractérisation individuelle des cellules en suspension ou particules isolées entrainées par un flux liquide jusqu'à une source d'excitation lumineuse. Elle permet également le tri cellulaire haute vitesse, qui correspond a une séparation physique de différentes sous-populations à partir d'une population hétérogène.

 Le personnel de la plate-forme possède les compétences scientifiques et techniques pour la mise en œuvre de projet depuis la préparation des échantillons jusqu'à l'analyse des données et assure les prestations et les formations nécessaires.
La plate-forme accepte tous les systèmes biologiques.
Ses ressources permettent de caractériser et séparer des populations de cellules, procaryotes comme eucaryotes, ou de particules (vésicules, nanoparticules, organites...) pour la recherche fondamentale et/ou clinique.

Nous proposons également une formation théorique et pratique à l'utilisation de chaque cytomètres analyseurs et si besoin du trieur de cellules. L'objectif de cette formation est que tous les utilisateurs deviennent rapidement autonomes et indépendants quant à l'utilisation des cytomètres.
Cette formation peut-être accompagnée, pour ceux qui le souhaitent, d'un encadrement personnalisé qui comprend :
  • une aide à la conception des expériences (en particulier sur le choix des fluorochromes)  une aide à l'analyse, à l'interprétation et à la présentation des résultats.
  • une adaptation de l'appareillage aux utilisations émergentes en développant de nouvelles mises aux points techniques.

La plate-forme participe à de nombreux workshops et congrès de cytométrie au niveau régional et national.

Applications

pot
  • Immunophénotypage échantillons biologiques (jusqu'à 15 fluorochomes).
  • Détection de molécules membranaires, intracellulaires (cytokines, phospho-protéines) et intranucléaires.
  • Etude de l'apoptose, du cycle cellulaire, de la prolifération cellulaire.
  • Dosage multiplex de cytokines, phospho-protéines.
  • Imagerie en cytométrie : co-expression, internalisation, spot-couting, morphologie.
  • Tri cellulaire de cellules animales et végétales, de levures, de bactéries.

Equipements

Un projet « qualité » est en place sur la plate-forme pour optimiser au maximum les performances de chaque instrument afin que tous les tests réalisés par les utilisateurs soient ultra-sensibles.

  • 3 Cytomètres analyseurs Calibur (2 lasers : 488nm et 633nm ; 4 PMTs)
  • 3 Cytomètres analyseurs Accuri (2 lasers : 488nm et 633nm ; 4PMTs)
  • 1 Cytomètre analyseur Canto HTS avec passeur de plaque haut débit (2 lasers : 488nm et 633nm ; 6 PMTs)
  • 5 Cytomètres analyseurs multi-paramétriques Canto II, LSRII IRSUN et LSRII IRS2, Celesta et Fortessa X20 (3/4 lasers : 355/405/488/633nm ; 15 PMTs)
  • 1 Cytomètre Facs Aria III trieur de cellules multi-paramétrique avec module de clonage sous PSM (5 lasers : 375/405/488/561/633nm ; 16 PMTs)
  • 1 Cytomètre Influx trieur de cellules jet in air avec module de clonage sous PSM (4 lasers : 355/405/488/642nm ; 18 PMTs)
  • 1 Cytomètre Imageur Image Stream X II (3 lasers : 405/488/633nm ; 10 PMTs)

Accès

petit pots
  • La plate-forme Cytocell réalise des prestations de service pour la communauté scientifique et pour les industriels.
  • Les systèmes sont accessibles aux utilisateurs souhaitant être autonomes après formation par le personnel de la plate-forme.
  • La réservation des systèmes est autorisée pour les utilisateurs formés via un logiciel d'administration de planning en ligne.
  • L'accès à la plate-forme Cytocell est soumis à tarification.

Exemples d'applications

Etude de la prolifération cellulaire

Marquage au CFSE, molécule qui se lie de façon covalente aux protéines intracellulaires et dont le marquage est divisé de façon égale entre les cellules filles.

Etude de l'apoptose précoce et tardive

Dosage de protéines dans le surnageant cellulaire ou d'autres liquides

Il est possible de doser jusqu'à 15 cytokines simultanément dans moins de 25µL

Immunophénotypage

Etude de sous-populations cellulaires infiltrant des tumeurs

Etude du flux calcique

Marquage avec la sonde Indo-1

Etude du cycle cellulaire

Marquage avec de l'iodure de propidium permettant de distinguer les différentes phases du cycle.














Immunophénotypage

Etude du statut effecteur/mémoire de lymphocytes T issus de sang de patients


Immunophénotypage

Etude de la phosphorylation de STAT-1 dans différentes sous-populations cellulaires